Η πιθανότερη προέλευση του ονόματος «Πρέσπα» έρχεται από το λατινικό «praesepe» που σημαίνει φάτνη,

καθώς οι λίμνες βρίσκονται στο μέσο μιας λεκάνης που διατηρεί έναν τεράστιο πλούτο άγριας ζωής.

Οι λίμνες αποτελούν έναν από τους  σημαντικότερους βιοτόπους της Ευρώπης.

Η Μικρή και η Μεγάλη Πρέσπα βρίσκονται σε υψόμετρο 850 μέτρων .

3 χώρες  , 2 λίμνες και βουνά που οι κορυφές τους αγγίζουν τα 2.000 μέτρα .272 είδη πουλιών που ανάμεσά τους ζει και αναπαράγεται η μεγαλύτερη αποικία αργυροπελεκάνων , περί τα 1.200 ζευγάρια, καθώς και 500 ζευγάρια ροδοπελεκάνων. Πρόκειται για την μοναδική περιοχή σε όλη την Ευρώπη που αναπαράγονται και τα δύο είδη σε τόσο μεγάλους αριθμούς .Πάνω από 1.500 είδη φυτών , 9 ενδημικά είδη ψαριών γλυκού νερού, 60 είδη θηλαστικών , όπως αρκούδα , λύκος, ζαρκάδι  και άλλα πολλά αποτελούν το φυσικό πλούτο των Πρεσπών .Η έκταση του Εθνικού Πάρκου φτάνει τα 195 τ.χλμ. από τα οποία τα 82 τ.χλμ. ανήκουν στα νερά των λιμνών.